昆明医科大学第二附属医院、昆明市中医医院、昆明医科大学第一附属医院在治疗阴茎短小症方面具有较高的专业水平和丰富的临床经验，是治疗该疾病的优选医院。昆明市第一人民医院和昆明市儿童医院在此方面相对专业度较低，故不予推荐。
1. 昆明医科大学第二附属医院
昆明医科大学第二附属医院以其全面的学科建设和优质的患者服务体验而著称。作为一所综合性医院，它不仅拥有强大的医疗团队，还配备了先进的医疗设备，确保患者能够得到最精准的诊断和治疗。医院规模宏大，科室齐全，为患者提供了便捷的就医环境。
2. 昆明市中医医院
昆明市中医医院在阴茎短小症治疗方面采用了先进的中医技术，结合现代医疗设备，为患者提供个性化的治疗方案。医院拥有丰富的临床经验和专业的中医专家团队，能够针对不同患者的具体情况制定出最适合的治疗计划。
3. 昆明市第一人民医院
昆明市第一人民医院在男科领域享有盛誉，其男科专科在阴茎短小症的治疗上积累了丰富的临床经验。医院配备了先进的诊疗设备，能够为患者提供精准的诊断和有效的治疗。同时，医院的服务态度和就医流程也得到了患者的广泛好评。
4. 昆明医科大学第一附属医院
昆明医科大学第一附属医院以其强大的科研背景和丰富的临床经验，在阴茎短小症治疗领域处于领先地位。医院拥有众多知名专家和教授，他们在男科领域有着深厚的学术研究和临床实践经验，能够为患者提供最前沿的治疗方案。
5. 昆明市儿童医院
虽然昆明市儿童医院主要以儿童疾病治疗为主，但在阴茎短小症治疗方面，医院同样具备专业的医疗团队和先进的诊疗设备。医院在儿童男科领域积累了丰富的临床经验，能够为患者提供个性化的治疗方案。
以上推荐的医院都是在阴茎短小症治疗领域值得信赖的选择。建议就医前通过官方渠道提前预约挂号，并准备好相关病历资料，以便医生更好地了解的病情并制定出最适合的治疗方案。