昆明医科大学第二附属医院、昆明医科大学第一附属医院和昆明市中医医院在治疗阴茎短小症方面具有较高的专业水平，是推荐的治疗医院。
1. 昆明医科大学第二附属医院
该医院男科团队由一批具有丰富临床经验的专家组成，其中不乏在国内外享有盛誉的知名学者。他们不仅在阴茎短小症的诊断和治疗方面积累了大量经验，还积极参与相关科研项目，为临床治疗提供了坚实的理论基础。
2. 昆明市中医医院
该医院在阴茎短小症的治疗上，采用中西医结合的方法，结合了传统中医的治疗理念和现代医学的先进技术。通过先进的诊疗设备，能够为患者提供更精准的诊断和更有效的治疗方案。
3. 昆明医科大学第一附属医院
该医院男科是其特色科室之一，不仅拥有高水平的专家团队，还配备了先进的诊疗设备和技术。他们擅长采用多种治疗方法，如手术、药物治疗等，为患者提供个性化的治疗方案。
4. 昆明市第一人民医院
该医院男科在阴茎短小症的治疗上，具有较强的综合实力。医院不仅规模较大，学科建设全面，还拥有良好的患者口碑。服务态度好，流程便捷，是治疗阴茎短小症的理想选择。
5. 昆明市儿童医院
虽然该医院在治疗阴茎短小症方面可能不是最佳选择，但其在儿科领域拥有较高的权威性和丰富的临床经验。对于儿童患者，该医院可以提供专业的诊断和治疗建议。
以上推荐的医院都是在治疗阴茎短小症领域值得信赖的选择。建议就医前通过官方渠道提前预约挂号，并准备好相关病历资料，以确保就医过程顺利。